В середине 1940-х годов в Казани на заводе им. Горбунова был создан футбольный клуб, который получил название «Крылья Советов». Первое время это была любительская команда, выступавшая на городских и межведомственных турнирах. Только в 1958-м году клуб получил профессиональный статус и был переименован в «Искру». Именно с этого момент ведётся история прославленной казанской команды «Рубин», которая впоследствии станет флагманом отечественного футбола.
ФК «Рубин» был основан в 1958-м году – когда руководство Футбольной федерации приняло решение расширить класс «Б» чемпионата СССР. На тот момент казанская команда носила название «Искра», и была составлена из игроков городских коллективов. Базовой же для «Искры» стал клуб авиационного завода № 22 имени С.П. Горбунова – именно это предприятие являлось главным спонсором казанцев вплоть до распада Советского Союза.
В середине 1960-х годов клуб переименовали в «Рубин». Инициатором ребрендинга стал директор авиационного завода Николай Максимов. Он предложил назвать клуб кратким ёмким и красивым именем, которое бы легко запоминалось болельщиком. Так и появился «Рубин». Согласно легенде, такое имя клуб получил в честь одноимённой Радиолокационной станции, которую устанавливали на бомбардировщик ТУ-16, выпускаемый Казанским авиазаводом.
В 1965-м году, сразу после переименования клуба, «Рубин» квалифицировался в группу «А». Лидером той команды был Виктор Колотов – единственный футболист казанцев, выступавший за сборную Советского Союза.
Однако надолго задержаться в элите у «рубиновых» не получилось. Уже в 1970-м году казанцы вылетели в Первую лигу, а в следующем сезоне – во Вторую. Через 3 года «Рубин» поднялся в Первую лигу, но надолго задержаться там не смог и опять рухнул во Вторую, где выступал вплоть до 1989-го.
Распад СССР не лучшим образом отразился как на самом клубе, так и на его спонсоре. Всё было настолько плохо, что команду могли расформировать. Только лишь сотрудничество с местными коммерческими организациями помогло «Рубину» выжить и продолжить своё существование. Особую поддержку оказала ассоциация социально-экономического развития «Тан». Несколько сезонов команда даже добавляла название спонсора к своему и называлась «Рубин-Тан».
Но вскоре клуб вернулся к старому названию («Рубин»), а его развитием лично занялся мэр Казани Камиль Исхаков, благодаря чему финансовая ситуация «Рубина» существенно улучшилась.
Очередной эпохальной датой в истории «Рубина» стало 12 августа 2001-го года. В этот день казанский клуб провёл первый матч под руководством Курбана Бердыева. Именно с этим тренером связаны главные успехи команды из столицы Татарстана.
В 2002-м году «Рубин» выиграл чемпионат Первой лиги и пробился в Высшую. Перед командой стояла задача закрепиться в элите, и по возможности – запрыгнуть в первую восьмёрку. Но клуб из Казани даже перевыполнил план. Уже в дебютном сезоне «Рубин» завоевал бронзовые медали чемпионата России, а в 2008-м впервые стал чемпионом страны. Через год команда повторила достижение, после чего стало понятно, что в России появился новый ТОП-клуб, который станет одним из флагманов отечественного футбола.
В сезоне 2009/10 «Рубин» дебютировал в Лиге Чемпионов, причём как! Казанцы не проиграли ни одного домашнего матча группового этапа ЛЧ, а в гостевом матче против «Барселоны» одержали победу со счётом 2:1.
В 2010-м году «Рубин» впервые выиграл Суперкубок России, обыграв столичный ФК ЦСКА со счётом 1:0. Единственный мяч на свой счёт записал Александр Бухаров.
Единственным трофеем, не покорившимся казанскому клубу на внутренней арене, оставался Кубок России. Но в 2012-м году и эта вершина была взята. 9 мая, в День Победы, «Рубин» в решающей встрече обыграл московское «Динамо», и завоевал очередной трофей.
В сезоне 2012/13 команда заняла лишь 6-е место в чемпионате, но при этом довольно успешно выступила на евроарене. Казанцы дошли до четвертьфинала Лиги Европы, уступив лишь будущему победителю турнира лондонскому «Челси».
С момента ухода Курбана Бердыева в 2013-м году с поста главного тренера «Рубин» выступает не лучшим образом. За это время казанцы ни разу не смогли завоевать трофей или даже зацепиться за медальную тройку. Результаты команды шли по ниспадающей, а исключением лишь стал сезон 2014/15, когда «Рубин» под руководством Рината Билялетдинова заняли 5-е место в чемпионате. После этого клуб балансировал на грани десятого места.
Летом 2017-го главным тренером «Рубина» вновь был назначен легендарный Курбан Бердыев. С его возвращением казанцы связывали большие надежды, но они не сбылись. Первый сезон при Бердыеве «рубиновые» закончили на 10-м месте, а следующий – на 11-м. Летом 2019-го руководство клуба приняло решение уволить Курбана Бекиевича с занимаемой должности по причине неудовлетворительных результатов.
В сезоне 2020/21 казанцев ждал очередной всплеск. Команда из столицы Татарстана неплохо провела чемпионат и заняла 4-е место. Но в следующем году она полностью провалилась и впервые за долгие годы вылетела из элитного дивизиона.
В середине сезона был уволен главный тренер Леонид Слуцкий, а его место занял Юрий Уткульбаев. Правда, и новый специалист проработал в Казани недолго. 12 апреля 2023 года контракт с Уткульбаевым был расторгнут по соглашению сторон, а на его место пришёл Рашид Рахимов. При новом тренере казанцы не проиграли ни одного матча, стали победителями Первой лиги и вернулись в РПЛ.